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樹立成功的細胞培養(yǎng)空間

人體內(nèi)有超過一萬億個細胞。這些整潔的包裹在精致的同步劃分,差異化,變形和伸展,毆打和伸展方面進行協(xié)作。就像類似于魔幻現(xiàn)實主義的東西一樣,這些獨立生活的微小構(gòu)件疊在一起,讓位于一個難以想象的復(fù)雜機器:人體。然而,每個細胞內(nèi)部都是一個巨大的宇宙,核心太陽位于其中心。

一百多年來,科學(xué)家們一直試圖窺探這些細胞,哄騙保護良好的秘密,挖掘產(chǎn)生生命(和死亡)的機制。但是,如果細胞附著在體內(nèi)器官上,怎么能理解細胞呢?

細胞培養(yǎng)以組織培養(yǎng)開始??茖W(xué)家們砍掉了一些動物和一些器官,并試著在盤子里養(yǎng)了幾天。**早的組織培養(yǎng)物由漂浮在溫鹽水中的雞胚組成。這項技術(shù)是由一位名叫Wilhelm Roux的胚胎學(xué)家在19世紀后期開創(chuàng)的。其他人很快效仿。20世紀帶來了一系列進步,**終使得細胞而不是組織被分離并保持在營養(yǎng)湯中。20世紀40年代帶來了**個小鼠淋巴細胞系; 20世紀50年代帶來了鷹的著名媒體配方以及現(xiàn)在備受爭議的HeLa系列的建立。

今天,基本原則保持不變,但技術(shù)以極快的速度發(fā)展。細胞現(xiàn)在無限期地存在于孵化器內(nèi)。干細胞轉(zhuǎn)化為心肌細胞,這些心肌細胞在板塊中敲打,或者是具有長而纏繞的軸突卷須的神經(jīng)元。成纖維細胞被重編程為干細胞。忘了兩個維度!癌細胞以三維(或四個,如果你加入時間成分)生長,模仿體內(nèi)的腫瘤??茖W(xué)家越來越接近治療前沿,進展是驚人的。

Lee Ligon是倫斯勒理工學(xué)院生物科學(xué)系的副教授和副主任。她與細胞一起工作了將近25年,并記得她早年在替補席上引起的興奮細胞培養(yǎng)。“我**次看到熒光線粒體在軸突和樹突中移動 - 現(xiàn)在聽起來很溫和,但當(dāng)時,它真是令人敬畏!”

Lee Lignon的實驗室

Lee Ligon實驗室的成員

如今,她的實驗室致力于制作仿生組織培養(yǎng)模型,特別是腫瘤微環(huán)境模型。“我們已經(jīng)開發(fā)出共培養(yǎng)多種細胞類型的方法,使用具有不同機械性質(zhì)的不同3D ECM(細胞外基質(zhì))模型,以及這些特征的各種組合。我們現(xiàn)在正致力于開發(fā)一種高通量的通量方法來研究腫瘤微環(huán)境的生物力學(xué)特性。“

更復(fù)雜的設(shè)置,同樣的老壞蛋

然而,盡管取得了無數(shù)進展,但仍有老敵人困擾著實驗并阻礙了調(diào)查結(jié)果。這些是微生物破壞者,大膽地在細胞培養(yǎng)實驗中建立了商店。這些是訓(xùn)練有素的工作人員,他們沒有完全掌握無菌技術(shù),偷工減料或忽視協(xié)議。根據(jù)科學(xué)家和**的說法,這些是新研究人員想要獲得成功和競爭力所需要的東西。

然而,盡管取得了無數(shù)進展,但仍有老敵人困擾著實驗并阻礙了調(diào)查結(jié)果。

韋恩州立大學(xué)藥理學(xué)副教授索科爾托迪強調(diào),正確培訓(xùn)員工**關(guān)重要:“污染始終是一個問題,永遠是一個問題。你可以擁有所有的花里胡哨,但是一旦你將人類引入等式,你就會遇到問題。自己培訓(xùn)你的員工,如果你不熟悉細胞培養(yǎng),請確保找到有經(jīng)驗的人或在線期刊并向他們學(xué)習(xí)。“考慮閱讀Geraghty RJ等人的文章,開始學(xué)習(xí)。1

同時要注意令人驚訝的污染源。例如,熒光燈可以光活化HEPES緩沖液,核黃素和色氨酸,從而產(chǎn)生過氧化氫和自由基。血清補充劑是生物和化學(xué)污染的常見來源。出于這個原因,**好堅持使用過去成功的特定來源和大量血清。

偽裝成乳腺癌的黑色素瘤 - 為什么細胞系驗證是優(yōu)先考慮的問題

迄今為止,有488個細胞系被交叉污染或錯誤識別。記錄這些細胞的數(shù)據(jù)庫由G際細胞系認證委員會維護。

其中**臭名昭著的是MDA-435(或MDA-MB-435)系列。這些細胞于1975年在實驗室研究中出現(xiàn)。從那時起,這些細胞出現(xiàn)在超過一千篇科學(xué)論文中,如乳腺癌細胞。然而,事實證明這是一個大問題。當(dāng)科學(xué)家檢查這些細胞的DNA時,他們驚呆了,發(fā)現(xiàn)MDA-435是黑素瘤系,而不是乳腺癌系。

期刊現(xiàn)在要求或強烈鼓勵科學(xué)家驗證他們的細胞系。2015年的自然評論呼吁科學(xué)家在這方面更積極主動,但承認共同的障礙:“如果我們排除無知和漠不關(guān)心,那么分析的成本和簡單性似乎是普遍使用細胞鑒定的**大障礙。” 2

STR(短串聯(lián)重復(fù))和SNP(單核苷酸多態(tài)性)分析代表了驗證細胞系同一性的可行方法。STR涉及分析遍布基因組的重復(fù)序列元素,長度為3-7個堿基對。SNP是同一物種成員之間的遺傳變異,在特定基因座內(nèi)是保守的,可用于確認同一性??梢垣@得用于SNP評估的商業(yè)試劑盒,而科學(xué)家可以將細胞發(fā)送到Promega或ATCC等公司進行STR分析。

非營利組織ATCC聲稱所有細胞系都在其網(wǎng)站上經(jīng)過STR驗證。此外,ATCC還推出了一個數(shù)據(jù)庫,科學(xué)家可以使用該數(shù)據(jù)庫將其結(jié)果與記錄的人類細胞系的概況進行比較。

分析也有局限性。雖然這些方法可用于建立同一性,但它們不評估細胞純度,即不存在種間交叉污染或污染物,例如病毒和微生物,表型,形態(tài)或細胞倍性。

康寧科學(xué)培訓(xùn)和教育經(jīng)理Mark Rothenberg博士警告說,應(yīng)該建立強有力的支原體檢測計劃。“支原體可以在引擎蓋中的一滴液體中保持活6-8天,并且很容易污染整個設(shè)施,”他解釋道。此外,雖然它與大多數(shù)實驗室建立的協(xié)議背道而馳,但他表示,除非建立原始培養(yǎng)物,否則應(yīng)考慮在培養(yǎng)基中不使用抗生素。“抗生素可以隱藏細菌的存在并增加污染其他培養(yǎng)物的風(fēng)險。”他強烈推薦康寧撰寫的關(guān)于如何管理污染的參考文章。3

遏制污染 - 使用技術(shù)和常識

無論空間或技術(shù)的復(fù)雜程度如何,良好的老常識都可以走很長的路。**銷售代表Brian Langenderfer與DAI Scientific合作了22年。他說,他看到的**大錯誤之一就是在人流量高的交通區(qū)域建立了細胞培養(yǎng)空間。

Natalie Swartz是位于底特律的SmithGroupJJR的實驗室設(shè)計師,他與大學(xué)和科學(xué)家合作設(shè)計符合他們需求的空間:“我們試圖設(shè)計靈活性; 這是我們**終看到的**大創(chuàng)新。“靈活性意味著高度可調(diào)的輪子上的長凳。人體工程學(xué)內(nèi)置于這些模塊化組件中,因此科學(xué)家可以根據(jù)任務(wù)站立或坐著。

在可能的情況下,她建議研究人員專注于“三角形設(shè)計”,這意味著生物安全柜,冰箱和培養(yǎng)箱在戰(zhàn)略上和附近安裝,同時采取一定的預(yù)防措施。例如,“流動罩不應(yīng)相互設(shè)置,因為氣流會污染樣品,”她說。“同樣,您需要距離生物安全柜三到四英尺的設(shè)備,這樣您就可以安全地取出樣品。”

羅滕伯格補充說,“孵化器應(yīng)放置在重型設(shè)備和電梯振動可能性**小的地方。”

所有**都提到,在建立細胞培養(yǎng)空間時,您應(yīng)該考慮在生物安全柜中使用哪些用品。您應(yīng)該能夠在不離開座位的情況下到達大部分物品。你打擾細胞周圍空氣的次數(shù)越少越好。

根據(jù)Swartz的說法,大多數(shù)實驗室都是在20世紀70年代設(shè)計的,然后在21世紀初進行了改造。通常,較舊的實驗室的設(shè)備與冰箱,培養(yǎng)箱和不同房間的引擎蓋分開。但是所有這些運輸都不好,并提供了無數(shù)的機會來妥協(xié)無菌空間。

如果您是在較老的空間中使用有限資源的眾多科學(xué)家之一,您可以采取許多步驟來設(shè)計成功的細胞培養(yǎng)空間。

Swartz建議您在設(shè)置工作空間時考慮三個主要方面:組織,合并和上述三角形配置。“shou先,組織空間。嘗試通過任務(wù)合并您將要使用的所有內(nèi)容。您可以創(chuàng)建任務(wù)區(qū)域,其中您需要的所有材料都在一個位置。使用輪子將物品移到生物安全柜,“她解釋道。此外,只要有可能,您應(yīng)遵循NIH指南。4

..在設(shè)置工作空間時考慮三個主要方面:組織,合并和......三角形配置。

Rothenberg回應(yīng)Swartz,并解釋說您可以在設(shè)施的范圍內(nèi)工作。有些事情無法避免。例如,如果有窗戶,請確保它們已密封。

創(chuàng)新與使用它的人一樣好

使用適當(dāng)?shù)脑O(shè)備也可以預(yù)防一些細胞培養(yǎng)事故。Langenderfer認為,如果使用得當(dāng),具有某些功能的技術(shù)可以防止很多麻煩??紤]超純凈去離子水的情況; 僅僅因為它非常干凈并不意味著它應(yīng)該用于每一項任務(wù)。“多年來,實驗室一直在孵化器中使用去離子水,這是不推薦的,因為水會從金屬中吸收離子,并且隨著時間的推移會在內(nèi)部產(chǎn)生銹斑,”他警告說。

“在引擎蓋上[事情的一面],如果實驗室人員使用紫外線燈替代良好的無菌技術(shù),那么我們作為[銷售]代表,無法控制這一點。然而,有一些功能,如紫外線計時器和一體式不銹鋼內(nèi)飾,有助于使清潔過程更快更容易,“Langenderfer說。

他繼續(xù)說道,“有些孵化器沒有好的控制器,因此如果實驗室技術(shù)人員打開門或忘記更換濕度盤中的水,可能不會發(fā)出警報。實驗室中發(fā)生的大多數(shù)事故都與研究人員對細胞培養(yǎng)過程的實驗技術(shù)培訓(xùn)有關(guān)。我們對所有設(shè)備進行所有免費在職培訓(xùn)。我們還介紹了所有控制器的正確使用和設(shè)置。在大多數(shù)情況下,是的,如果實驗室人員正確使用和維護設(shè)備,設(shè)備就很棒。“

較新的設(shè)備考慮到了科學(xué)家們的艱辛和艱苦的**。功能包括警報,可調(diào)節(jié)的高度和椅子,引擎蓋和長凳的輪子,以及改進的抗菌表面。雖然整篇文章都可以寫在上面,但Swartz和Langenderfer都強調(diào)了盡可能利用節(jié)能設(shè)備的重要性。如果您的部分補助金專門用于運營成本,那么這**是您需要考慮的事項。從長遠來看,你免費繼承的舊孵化器或引擎蓋可能不值得。做你的腿部工作; “不要只購買顧問所擁有的同樣的老式孵化器,”Ligon說。

Swartz警告說,一個通風(fēng)櫥消耗的能量與每天3.5個家庭一樣多,這是一個巨大的數(shù)額。盡可能在恒定容積罩上選擇可變風(fēng)罩。此外,“盡可能降低窗扇,”她建議道。“如果你使用較低的窗扇或低流速罩,你可以節(jié)省高達40%的運營預(yù)算。”

Langenderfer提供了一些分離建議:“在建立細胞培養(yǎng)實驗室或任何研究實驗室時,不要只購買目錄中的主要設(shè)備; 聯(lián)系設(shè)備**。**終,這將節(jié)省您的時間和寶貴的研究資金,并為您提供與您的研究應(yīng)用相匹配的精確設(shè)備。“

參考

1.Geraghty,RJ等人,“生物醫(yī)學(xué)研究中使用細胞系的指南”,英G癌癥雜志,111(6),1021-1046,2014。[PMID:25117809 ] 

2. Freedman,LP等人,“再現(xiàn)性:改變細胞系認證的政策和文化”,Nat Methods,12(6):493-7,2015。[PMID:26020501 ] 

3. Ryan,J,  理解和管理細胞培養(yǎng)污染,技術(shù)公報,康寧生命科學(xué)。 

4. NIH設(shè)計政策和指南,研究設(shè)施辦公室。 

圖片:Shutterstock Images和Lee Ligon的實驗室

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